L’UMT Fastypers vient d’être créée pour cinq ans. Sa mission : développer des outils permettant de caractériser et détecter les souches bactériennes persistantes comme Salmonella et Listeria, dans la filière porc et la filière lait.

Comprendre et mieux détecter Salmonella et Listeria : l’UMT Fastypers s’y attelle

31 janvier 2022 - maria guillon

L’UMT Fastypers vient d’être créée pour cinq ans. Sa mission : développer des outils permettant de caractériser et détecter les souches bactériennes persistantes comme Salmonella et Listeria, dans la filière porc et la filière lait.

La présence des bactéries Listeria et Salmonella dans les ateliers de transformation pose plusieurs problèmes : ces pathogènes  sont capables de persister longtemps dans l’environnement et de résister aux traitements par des produits biocides. En associant les équipes de recherche de l’Anses et de l’Inrae ainsi que des instituts techniques, Actalia pour la filière laitière et l'Institut du porc (IFIP), la création de l’Unité mixte technologique (UMT) Actia Fastypers va combiner les expertises.

Comprendre les mécanismes

Prévus pour une durée de cinq ans, les travaux de l’UMT visent d’une part à comprendre par quels mécanismes ces bactéries arrivent à s’adapter et à persister dans l’environnement extérieur, y compris dans des ateliers agro-alimentaires, et d’autre part à développer des outils pour caractériser et détecter ces souches bactériennes persistantes.

Ces travaux seront menés conjointement dans les filières porc et lait, les plus concernées par ces souches bactériennes. Deux unités de l’Anses seront impliquées dans l’UMT : l’unité Salmonella et Listeria, du laboratoire de sécurité des aliments apportera son expertise dans la caractérisation génomique des souches, afin d’identifier quel génotype est associé aux caractéristiques étudiées (résistance aux métaux lourds, persistance dans l’environnement, virulence, etc.) ; tandis que l’unité Antibiotiques, biocides, résidus et résistance du laboratoire de Fougères étudiera l’adaptation et la résistance des bactéries aux produits biocides de nettoyage utilisés. Ces travaux seront en lien avec le Réseau mixte technologique Chlean, consacré à l’hygiène des équipements de l’industrie agro-alimentaire, dans lequel sont déjà impliqués les deux laboratoires.

Développement d’outils de routine

Le but de Fastypers est de développer des outils utilisables en routine par les producteurs et les industriels pour identifier les souches de bactéries présentes aux différentes étapes de production des aliments, depuis les élevages jusqu’aux produits finis. « Il s’agit d’optimiser et de simplifier les outils dont nous disposons pour la recherche, afin de permettre aux instituts techniques d’identifier à la fois la virulence et la capacité de persistance des souches simplement en récoltant les bactéries présentes sur les surfaces à l’aide de chiffonnettes de prélèvement », explique Sophie Roussel, co-animatrice de l’UMT et scientifique du laboratoire de sécurité des aliments. Ces analyses ont pour finalité d'adapter le processus de nettoyage et de désinfection aux caractéristiques des souches bactériennes susceptibles d’être retrouvées dans les environnements agro-industriels, par exemple en utilisant les produits désinfectants les plus efficaces contre les bactéries présentes dans ces usines.

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