Dans le cadre de son dispositif Nutrivigilance, l’Anses a reçu 49 déclarations d’effets indésirables susceptibles d’être liés à la consommation de compléments alimentaires contenant de la spiruline. L’Agence a donc délivré un avis où elle convient qu’il n’y a pas de risque sanitaire à de faibles doses (jusqu’à plusieurs grammes par jour), sauf en cas de contamination aux cyanotoxines, aux bactéries et aux éléments traces métalliques. Elle recommande donc aux consommateurs de privilégier les circuits d’approvisionnement les mieux contrôlés. Les producteurs français étant identifiés et surveillés, le risque de contamination est moindre.

D’autre part, l’Anses déconseille aux personnes atteintes de phénylcétonurie (maladie génétique rare liée à l’accumulation de phénylalanine dans l’organisme) ou présentant un terrain allergique de consommer de la spiruline. Enfin, l’Agence souligne que la spiruline ne constitue pas une source fiable de vitamine B12 pour les populations végétaliennes, celle-ci étant présente dans la spiruline majoritairement sous forme d’analogue inactif.